茶树硒代半胱氨酸甲基转移酶基因生物信息学分析

摘要：

为揭示茶树(Camellia sinensis)硒代半胱氨酸甲基转移酶(Selenocysteine methyltransferase,SMT)基因CsSMT的生物学功能及其分子调控机理,利用生物基因组学数据库和生物信息学分析软件,对CsSMT进行生物信息学分析,预测该基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建CsSMT同源基因的系统进化树.结果表明:CsSMT基因cDNA全长1368 bp,开放阅读框位于50～l105 bp处.编码产物为稳定的亲水性蛋白,分子式为C11670 H2645 N459 O532 S15,无跨膜结构,无信号肽,定位于细胞质基质.二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维建模成功.系统进化分析表明,CsSMT基因mRNA与拟南芥同型半胱氨酸S-甲基转移酶基因(Homocysteine S-methyltransferase,HMT)聚为一组.

关键词：茶树、CsSMT基因、生物信息学

所属期刊栏目：26

分类号：S571.1

资助基金：贵州省农业科学院专项“谢瓦氏曲霉间型变种基因组测序、分析及有性产孢相关功能基因的初步研究”黔农科院专项2011037

在线出版日期：2014-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2221-2226