木薯耐旱基因CAT的生物信息学预测与分析
利用在线提供的生物信息学软件及Pathway Studio软件,以木薯(Manihot esculenta)过氧化氢酶(CAT)为研究对象,与蓖麻、麻风树、橡胶树、常绿大戟、杨树、盐地碱蓬、樟子松、水稻、甘薯、马铃薯10种植物CAT的氨基酸序列进行比较分析,揭示CAT氨基酸结构与耐旱特性的相关性.结果显示,木薯CAT1全长为1782bp,包含一条长1479 bp的开放读码框,编码492个氨基酸,通过同源性比对发现木薯CAT氨基酸序列与蓖麻、麻风树、橡胶树、常绿大戟、杨树、盐地碱蓬、樟子松、水稻、甘薯、马铃薯的同源性分别为82％、92％、81％、84％、80％、80％、79％、78％、78％、80％.木薯与麻风树同源性达到最高,为92％,最低是水稻和甘薯,为78％.木薯及其它10种植物CAT氨基酸序列的共同点为:没有导肽,不存在信号肽,为亲水性蛋白,无规则卷曲是最大量的结构元件,β-转角是最小的结构元件.此外,对跨膜结构域进行预测,木薯及其它10种植物均不存在跨膜结构域,但木薯CAT1整条肽链都位于膜内,其它10种植物的CAT均在膜外.CAT通过生物调节互作网络,在水杨酸(SA)、SOS及脱落酸(ABA)等的多重作用下,调节植物过氧化氢(H2O2)含量,提高植物抵抗逆境的能力.
木薯、生物信息学、耐旱基因、CAT
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S533(薯类作物)
国家“973”重点基础性研究项目2010CB126606;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项PZS035,PZS062;国家“863”基金项目2012AA101204-2
2014-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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