凡纳滨对虾3个sHSP成员的序列与表达特征分析
通过搜索凡纳滨对虾EST数据库,获得3个包含完整开放阅读框的sHSP cDNA序列.对3个sHSP cDNA和相应蛋白序列进行多序列比对发现,3个sHSP的cDNA序列同源性非常高,均达到95%以上,但在开放阅读框第376 bp之后,3个基因间有多个插入和缺失突变,使编码的蛋白序列在C端有较大差异,sHSP-1与sHSP-2、sHSP-3蛋白的同源性只有86.5%和78.7%.不同物种多个sHSP蛋白序列构建的系统进化树显示,3个sHSP与其他物种的HSP20.6、HSP21.4和HSP Beta亲缘关系都很近,推测不同物种sHSP起源相似,且同一物种的不同sHSP通过基因复制产生.运用荧光定量PCR分析了sHSP-1和sHSP-2基因在凡纳滨对虾不同组织及低温胁迫处理下的表达,结果显示,sHSP-1和sHSP-2均在肌肉组织中优势表达,并在低温诱导对虾肌肉组织中呈上调表达,暗示sHSP基因可能在对虾应对低温时发挥功能.
凡纳滨对虾、EST库、低温胁迫
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S945.4+6(水产保护学)
现代农业产业技术体系建设专项CARS-47;广西自然科学基金项目2011GXNSFD018020;广西科学研究与技术开发计划项目桂科合1140010-17
2013-12-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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2127-2132