凡纳滨对虾COPE基因序列及低温表达分析

摘要：

通过对已知耐寒候选基因-COPE基因的克隆和研究,为凡纳滨对虾耐寒性状的分子机理研究提供依据.运用同源克隆和RACE-PCR技术获得凡纳滨对虾COPE基因(LvCOPE)全长cDNA序列,对其进行了生物信息学分析,采用荧光定量PCR研究了LvCOPE基因的组织表达谱及其在低温胁迫下表达量的变化.结果显示,LvCOPEcDNA全长1217 bp,包含888 bp开放阅读框,编码296个氨基酸残基,具有保守的TPR结构域.各物种COPE蛋白序列构建的系统进化树能准确反映各物种间的进化关系.IvCOPE mRNA在各组织中呈遍在表达,在肌肉组织中表达量最高.低温表达谱分析显示,bCOPE mRNA在低温处理对虾的肝胰腺、心、鳃、肌肉等组织中均呈下调表达,随着处理温度由15℃降至11℃度,其在肝胰腺中表达量逐渐降到最低.因此,LvCOPE在结构和进化上保守,在低温胁迫时呈下调表达,可能在寒冷耐受过程中发挥负调控功能.

关键词：凡纳滨对虾、COPE基因、基因表达、低温、荧光定量PCR

所属期刊栏目：26

分类号：S945.4+6(水产保护学)

资助基金：广西壮族自治区直属公益性科研院所基本科研业务费2060302 GXIF-2010-04;现代农业产业技术体系建设专项资金CARS-47

在线出版日期：2013-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：371-376