番茄脂肪氧化酶D基因的克隆分析和植物表达载体的构建

摘要：

利用RT-PCR方法从番茄中克隆了TomloxD的cDNA.采用生物信息学,ChloroP,SMART方法对TomloxD分析与研究,结果表明,TomloxD基因编码是一个由908个氨基酸残基组成的蛋白,蛋白分子量为102.31 kD.在蛋白的N-端有77个氨基酸组成的叶绿体信号肽.TomloxD是一种植物脂肪氧化酶,具有两个保守结构域:在靠近N-端区域有PLAT/LH2结构域,在C-端有pfam:lipoxygenase结构域.TomloxD蛋白与大豆LOX3蛋白三维结构高度重叠.TomloxD与来自马铃薯、烟草、油橄榄、拟南芥和玉米的脂肪氧化酶的一致性分别为96％、90％、82％、72％和67％.系统进化关系分析表明TomloxD与来源于双子叶植物的脂肪氧化酶蛋白的亲缘关系更近,而与单子叶植物的相对较远.构建植物高效表达载体TomloxD-pBIN19,并导入根癌农杆菌LBA4404中,得到植物转化工程菌,这为下一步用于番茄等作物的转基因操作,进一步研究TomloxD基因的功能,获得高抗逆性的转基因作物奠定了基础.

关键词：番茄、番茄脂肪氧化酶D基因、生物信息学、蛋白质结构、载体构建

所属期刊栏目：26

分类号：S641.2

资助基金：重庆市自然科学基金项目cstc2011jjA80027;重庆市教育委员会科学技术研究项目KJ121106;重庆三峡学院科学研究计划11ZZ-043

在线出版日期：2013-05-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：271-277