猪伪狂犬病病毒gD基因的克隆与分析

摘要：

克隆测定12条PRV不同毒株的gD全序列连同Genebank中登录的9条gD基因全序列共21条基因序列,使用生物软件对它们的基因序列的同源性、突变区域的定位、遗传进化关系、氨基酸序列的同源性、蛋白质亲水性、抗原表位分析、三级结构预测等生物信息学的内容进行预测和分析.结果表明:PRV-gD基因的开放阅读框的核苷酸长度在1197～1215nt之间,氨基酸长度在399～405个之间,核酸同源性在97.3%～100%之间,氨基酸的同源性在89.8%～98.8%之间,在核酸820～837位有个高变重复区.在遗传进化关系上将我国PRV流行分为四川、华北、东南三个区域.该结果说明PRV-gD基因具有很高的保守性.

关键词：伪狂犬病病毒、gD基因、克隆、序列分析、生物信息学

所属期刊栏目：20

分类号：S858.28(动物医学（兽医学）)

资助基金：教育部长江学者和创新团队发展计划IRT0555;四川省应用基础研究计划03JY029-40

在线出版日期：2007-11-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：800-806