Ⅰ型蓝舌病毒NS4基因的克隆及序列分析

摘要：

为研究蓝舌病毒NS4基因分子特征,本研究从重庆分离的蓝舌病毒(BTV-1/China/2017)感染细胞提取总RNA,采用RT-PCR方法对蓝舌病毒(BTV-1/China/2017)NS4基因进行克隆与序列分析.结果 表明:所获得的NS 4基因ORF长234 bp,编码77个氨基酸.通过DNAMAN软件分析,表明本研究中克隆的NS4基因与BTV-8/Netherland/2008/03,BTV-4/Italy/2003,BTV-4/Israel/2010,BTV-8/Israel/2010/03,BTV-1/France/2007/18,BTV-1/France/2008/24,BTV-1/Algeria/2006/01,BTV-2/Sudan/1983/05,BTV-14/Cameroon/1982/04株相似性为100％,与BTV-2/South Africa/RSA vaccine strain,BTV-9/South Africa/RSA vaccine strain株及BTV-1/Libya/2007,BTV-2/Italy/2000等25株参考毒株的相似性为98.7％,而与BTV-1/Australia/2003/01和BTV-16/Indone-sia/1998相似性最低,为90.8％;突变主要发生在5～6位、17～18位、35～36位、39～40位、53～54位、65位及73～74位.系统进化分析表明:BTV-1/China/2017株NS4基因与欧洲源BTV-4/Italy/2003,BTV-8/Netherland/2008/03,BTV-2/France/2001,BTV-15/Israel/2006,BTV-4/Israel/2010,BTV-1/France/2008/24,BTV-4/Spain/2005株聚为一类,同BTV-4/Italy/2003株亲源关系最近.通过在线软件预测发现NS4蛋白存在2个α-螺旋区,无跨膜区,具有亮氨酸拉链(bZIP)典型结构;存在典型的核定位信号并具有线粒体亚细胞定位特征.

关键词：蓝舌病毒、NS4基因、序列分析

所属期刊栏目：42

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：中央高校基本科研业务专项基金项目;重庆市基础研究;前沿探索专项基金项目

在线出版日期：2020-10-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：77-86