蛋鸡资源群体的盲肠长度全基因组关联分析

摘要：

[目的]盲肠是鸡进一步消化和吸收养分,尤其是纤维的器官,对鸡的生长及后期产蛋都具有重要作用,因此鸡的盲肠长度是一个重要的生理指标.[方法]通过对白来航鸡与东乡绿壳蛋鸡杂交所得F2代个体的盲肠长度进行测量,并运用单核苷酸多态性(SNP)芯片检测其基因分型,根据SNP检测数据运用SAS进行遗传评估,并用全基因组混合模型关联算法(GEMMA)进行单变量全基因组关联分析(GWAS).[结果]结果显示,盲肠长度表现出中等遗传力(0.39).GWAS鉴定出54个SNP与盲肠的长度显著相关,且1号染色体170 Mb附近对于盲肠长度来说是一个重要区域.在这个区域,覆盖26个SNP位点的18个基因被定为候选基因,其中2个分别在编码序列(CDS)和3’非翻译区(3'UTR),对应于NHLRC3和SIAH3,它们可能是影响盲肠长度的重要SNP位点和基因.[结论]利用GWAS筛选并鉴定出和鸡盲肠长度相关联的SNP位点及基因,将为揭示蛋鸡盲肠发育的机制和分子育种提供基础.

关键词：蛋鸡、盲肠长度、GWAS、遗传结构

所属期刊栏目：40

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：财政部、农业部国家蛋鸡产业技术体系项目CARS-41-K02;江苏省农业科技自主创新项目CX161008;江苏省农业三新工程项目SXGC[2016]290

在线出版日期：2019-02-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：35-41