用于研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库的制备

摘要：

以柑橘属Swingle分类系统界定的16种柑橘物种的基因组DNA为材料,构建了研制柑橘DArT芯片的DNA探针文库,进而从中随机挑选出15 000条探针用于柑橘DArT芯片的开发.柑橘物种的基因组DNA采用改良CTAB法提取并等量混合,经Eco RI和Mse Ⅰ双酶切后连接接头序列,再使用选择性引物进行PCR扩增,并将扩增产物转化大肠杆菌,构建探针文库.从探针文库中随机挑选出15 000个阳性单克隆,通过PCR扩增和纯化获得了15 000条用于制备DArT芯片的DNA探针.凝胶电泳检测显示所制备的DNA探针的纯度和浓度均满足了研制DArT芯片的要求.为采用DArT芯片快速鉴定柑橘物种并研究其进化关系奠定了基础.

关键词：柑橘属、DArT芯片、探针、文库

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分类号：S666;S602.3(果树园艺)

资助基金：国家自然科学基金项目NSFC31171930;西南大学博士基金项目SWU111028;中央高校基本科研业务费专项资金项目XDJK2013C027.

在线出版日期：2016-03-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

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