植物DNA甲基转移酶的生物信息学分析

摘要：

运用生物信息学的方法和软件对油棕、桃树、豌豆、胡萝卜、拟南芥等植物的DNA甲基转移酶的核酸及其氨基酸序列进行了组成成分、理化性质、同源性比对分析,进而对其信号肽、跨膜结构域、疏水性和亲水性、蛋白质二级及三级结构、分子系统进化等重要参数进行预测和推断.结果表明:DNMT的全长cDNA包括5'非翻译区、一个开放阅读框和3'非翻译区,该蛋白无信号肽和蛋白转运肽,是一个亲水性蛋白,具有两个BAH和一个DNA甲基化酶结构域,其二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主要结构元件,各个结构域之间可以依靠静电作用依次结合.

关键词：DNA甲基转移酶、生物信息学、DNA甲基化

所属期刊栏目：32

分类号：Q811.4(生物工程学(生物技术))

资助基金：海南省自然科学基金资助项目809031

在线出版日期：2010-11-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：83-89