牦牛DIO2基因克隆及其在骨骼肌的表达分析

摘要：

为探索DIO2基因调控牦牛骨骼肌发育及肌纤维类型组成的潜在功能,克隆DIO2基因CDS序列并进行相关的生物信息学分析,以及比较分析其在牦牛骨骼肌的差异表达.结果显示,DIO2基因的CDS全长为789 bp,编码132个氨基酸.序列同源性比对及系统进化树分析发现,牦牛DIO2基因与普通牛的亲缘关系最近,核酸及蛋白序列与普通牛一致;与小鼠的亲缘关系较远,序列同源性仅为86.75％和87.12％,与原鸡的亲缘关系最远,二者的同源性分别为79.17％和76.30％.理化性质预测表明DIO2蛋白为不稳定疏水性蛋白,有跨膜结构域,具有24个磷酸化位点,蛋白结构为无规则卷曲、α-螺旋和延伸链三者交替出现.采用实时荧光定量PCR分析显示,DIO2基因在牦牛的脾、肺等内脏组织表达无显著差异;在背最长肌和半腱肌的表达量显著高于脂肪和肝脏组织(P＜0.01).此外,DIO2在金川牦牛半腱肌的表达量显著高于麦洼牦牛(P＜0.05).以上结果为研究DIO2在牦牛骨骼肌的功能提供参考资料.

关键词：牦牛、DIO2基因、骨骼肌、组织表达分析、生物信息学分析

所属期刊栏目：45

分类号：S823.8+5(家畜)

资助基金：四川省科技计划项目;中央高校优秀学生培养工程项目;国家自然科学基金项目

在线出版日期：2020-04-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：551-558