红花EST-SSR分子标记开发与初步验证

摘要：

旨在开发红花EST-SSR标记,为红花分子辅助育种和种质资源评价提供有力工具.先对红花转录组进行测序,选用MISA软件筛选鉴定SSR位点.在云南红花(YH)转录组中,共获得46 016个SSR位点,分布频率为32.09％,平均每3.11 kb有一个SSR.云南红花SSR位点以二,三核苷酸重复基序为主,其优势重复基序分别为AG/CT(44％)和AAG/CTT(24％).SSR位点重复次数相差较大,其中重复为5次比率最高,SSR位点数为9 369(26.63％),其次为6次(8 148,23.16％).同时,利用Primer3.0进行引物设计,随机筛选27对引物,在60份不同来源红花种质中进行多态性验证,获得12对具有多态性稳定的引物,多态性引物比率为44.4％.结果表明,基于红花转录组序列开发SSR标记是可行的,开发的标记具有稳定扩增性,丰富多态性等优点,开发的SSR标记将有助于红花功能基因挖掘,遗传连锁图谱构建和遗传多样性分析.

关键词：红花、转录组、EST-SSR、多态性、遗传多样性

所属期刊栏目：45

分类号：Q94(植物学)

资助基金：湖北省重点实验室后补助专项2018BFC360;国家油料种质资源平台NICGR2018-014;农作物种质资源保护与利用2018NWB033

在线出版日期：2019-05-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：146-154