肯尼亚拟盘多毛孢几丁质酶基因鉴定及表达分析

摘要：

利用生物信息学方法从重寄生肯尼亚拟盘多毛孢(Pestalotiopsis kenyana)PG52菌株基因组中挖掘几丁质酶基因并分析,通过检测锈孢子诱导不同时间段基因的表达情况筛选重寄生相关几丁质酶基因.结果表明:在PG52中共鉴定到20个GH18家族和1个GH19家族几丁质酶基因,分子量38.0～177.2 kDa,理论pI值范围3.97～9.25;其中7个有信号肽,13个定位在胞外.所有PGChns基因都含有GH18家族或GH19家族保守结构域;与木霉几丁质酶序列聚类分析显示,PG52含有7个sgA、4个sgB、8个sgC、1个sgD几丁质酶基因.锈孢子诱导下共18个几丁质酶基因在转录组中被检测到表达,7个基因在诱导24 h时表达量最高,6个基因在经诱导后持续下调表达,4个基因在诱导72 h时表达量最高.对6个表达量高以及表达倍数高的基因进行RT-qPCR分析,所有基因均出现显著差异表达,并在诱导72 h时表达量最高.经诱导后上调表达的PGChns很可能在PG52菌株重寄生过程中发挥破坏锈孢子壁的作用,需要后续进一步验证.

关键词：拟盘多毛孢、几丁质酶、重寄生、表达分析、实时荧光定量PCR

所属期刊栏目：44

分类号：S182(农业生物学)

资助基金：云南省农业基础研究专项面上项目;生物学质量工程项目

在线出版日期：2024-02-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：21-30