芳樟叶片转录组测序及萜类合成调控相关基因表达分析
通过Illumina HiSeqTM 2000高通量测序技术对芳樟和杂樟(对照)叶片进行转录组学测序分析,并对所涉及的Unigene在GO、Nr、Nt、Pfam、KOG、Swiss?prot和KEGG中进行分类、功能注释和Pathway注释.结果表明:2类樟树叶片转录组检测共产生34.45 GB clean数据,组装了312457个Unigene.其中,11685个Unigenes鉴定为芳樟叶和杂樟叶的差异表达基因,在芳樟中6481个被鉴定为上调的Unigenes和5204个为下调Unigenes;对其进行GO功能富集发现并鉴定了编码萜类合成酶Unigenes 39个,包括单萜生物合成6个,二萜生物合成7个,倍半萜和三萜生物合成12个,萜类骨架合成14个.对萜类合成酶TPS14基因进行转录组FPKM和q?PCR验证发现,其表达量在芳樟中较杂樟更低,可能与其转录过程的选择性剪切有关.通过SSR位点分析,从88016个Unigene中共检测到134851个SSR位点,其中单个SSR位点有103478个Unigene,含2个及2个以上SSR位点有31373个Unigene.
芳樟;基因;注释;转录组分析;表达分析;SSR标记
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S792.23(森林树种)
江西省教育厅科学技术研究项目GJJ170252
2021-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
49-57
