枸杞自交不亲和基因S-RNase密码子偏性分析

摘要：

为了掌握枸杞S-RNase密码子及其使用偏好性,利用EMBOSS和CodonW软件分析了枸杞S-RNase基因密码子的使用偏好性,并将其与酵母、大肠杆菌和柑橘等10种植物S-RNase基因密码子偏好性进行比对,结果表明:枸杞S-RNase密码子偏好以A/T结尾;RSCU值显示该基因高频率使用的密码子有9个,相较其他物种同源基因存在明显的密码子偏好性差异.此外,较密码子使用偏好性分析结果,基于S-RNase基因编码序列的聚类结果更能准确地反应物种之间的亲疏关系.比对其他物种该基因密码子的使用频率发现,同科物种差异较小,不同科物种差异较大;同时对比使用频率发现,枸杞S-RNase基因更适合导入酵母菌进行异源表达,但需要对其进行适当优化改造.

关键词：枸杞、密码子、偏好性、S-RNase、聚类分析

所属期刊栏目：40

分类号：S336(作物遗传育种与良种繁育)

资助基金：宁夏回族自治区农业育种专项项目2018NYYZ0102

在线出版日期：2020-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：44-52