基于NGS技术的仔猪腹泻病毒检测

摘要：

为探究四川某猪场反复暴发仔猪腹泻的原因,利用下一代测序技术(NGS)对该猪场的仔猪肠道样品进行检测,结合常规PCR、 测序方法进行验证分析.结果表明:该猪场存在猪流行性腹泻病毒PEDV,通过对该场PEDV S1基因的进化树分析,发现该PEDV毒株属于独立的一个分支;同时还在该场病料中检测到猪圆环病毒3型(PCV3),该猪场腹泻问题可能是由于新型PEDV毒株和PCV3毒株混合感染导致.

关键词：NGS、猪、腹泻、病毒、PEDV、PCV3

所属期刊栏目：38

分类号：S858.28(动物医学（兽医学）)

资助基金：云南省优势特色重点学科生物学一级学科研究生科技创新基金第二批50097505 资助;云南省研发经费投入补助项目2017YB236&2016YB462 资助

在线出版日期：2018-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：112-118