8种植物CHI基因的生物信息学分析

摘要：

根据GenBank上已登录的拟南芥、苹果杂交种、草莓、桃、沙梨的栽培种美人酥、葡萄、柑橘和玉米的查尔酮异构酶基因蛋白质氨基酸残基序列,应用生物软件对其组成成分、导肽、信号肽、跨膜结构域、疏水性与亲水性、蛋白质二级和三级结构以及功能域进行预测和分析.结果表明:8种植物的CHI不具有导肽,不存在信号肽,不具有跨膜结构,推测CHI可能定位于细胞质基质中发挥功能,多肽链总体表现为亲水性；有α-螺旋、β-转折、无规则卷曲和延伸链4种二级结构,除了无规则卷曲是桃的最主要二级元件外；其余7种植物均是α-螺旋为最主要的结构元件；8种植物可能均有1个查尔酮异构酶活性部位.

关键词：查尔酮异构酶、生物信息学分析、蛋白质功能预测

所属期刊栏目：33

分类号：S718.46(林业基础科学)

资助基金：西南林业大学森林培育与经营学科500961;国家林业局重点实验室开放基金BC2010F08;西南林业大学科研启动基金

在线出版日期：2013-08-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：88-95