早园竹叶绿体atpA基因序列及系统进化分析

摘要：

在构建叶绿体DNA基因组文库的基础上,克隆了早园竹叶绿体atpA基因,与禾本科水稻、玉米等11种植物atpA基因的SNP对比分析发现,早园竹与供试禾本科植物叶绿体atpA基因序列间共有110个SNP位点,其中与水稻Indica, Japonica和野生稻之间仅有1个SNP位点;与玉米、高粱、甘蔗及杂交甘蔗之间有2个SNP位点;而与小麦、大麦、匍茎剪股颖和黑麦草之间的SNP位点较多.基于atpA基因序列和编码氨基酸序列构建的Neighbor-joining系统进化树显示,供试的禾本科植物在系统进化上可划为2个进化类群和4个进化亚群,水稻与早园竹处于同一亚群.表明早园竹在进化关系上与水稻最近,其次与甘蔗、玉米和高粱进化关系较近,而与麦类及其近缘植物的进化关系较远.

关键词：早园竹、禾本科植物、atpA基因、序列分析、系统关系

所属期刊栏目：29

分类号：Q943.2(植物学)

资助基金：国家"948"项目2004-4-60;北京农学院三项基金重点项目资助;云南省重点建设学科西南林学院森林培育学基金项目500018

在线出版日期：2009-06-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：31-36