郏县红牛和安格斯牛18月龄背最长肌差异表达基因的筛选与分析
旨在通过转录组学分析筛选出影响牛肌肉发育的候选基因.对5头18月龄的郏县红牛背最长肌进行转录组测序,获得转录组数据后与3头18月龄安格斯牛背最长肌的转录组数据(GSE57327)进行联合分析.结果:与安格斯牛相比,郏县红牛背最长肌中4 945个基因表达显著上调(FDR＜0.05),2 186个基因显著下调(FDR＜0.05).GO功能富集分析显示差异基因主要富集在与代谢相关生物学过程中.KEGG信号通路分析显示差异表达的基因主要富集到氧化磷酸化(oxidative phosphorylation)等通路上.从氧化磷酸化通路中筛选出两品种间差异表达最显著的20个基因,通过反刍动物基因组数据库(ruminant genome database,RGD)查看该20个基因的组织表达情况,其中泛素-细胞色素c还原酶复合物Ⅲ亚基Ⅺ(UQCR11)、细胞色素c氧化酶亚基7A1(COX7A1)、细胞色素c铜伴侣蛋白(COX17)、NADH氢酶辅酶Q铁硫蛋白5(NDUFS5)和线粒体ATP酶合成体ε亚基(ATP5F1E)这5个基因在牛骨骼肌组织中的表达量高于其他组织,推测这5个基因在牛的生长发育过程中可能发挥重要作用,可作为候选基因进行进一步验证.
郏县红牛、安格斯牛、转录组、肌肉、候选基因
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S823(家畜)
河南省科技攻关项目;河南省农业科学院优秀青年科技基金;河南省重大公益专项项目;中原学者工作站项目;国家肉牛牦牛产业技术体系项目;河南省肉牛产业技术体系项目
2023-06-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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