中国部分马、驴种质资源CYTB条形码遗传多样性分析
旨在构建我国部分马、驴细胞色素b(CYTB)基因的DNA条形码数据库,并研究其遗传多样性.以全国不同区域的8个马和3个驴品种共计149例样本为研究对象,以CYTB为候选基因,构建DNA条形码数据库,并与前期获得的细胞色素氧化酶Ⅰ(CO Ⅰ)和16S rRNA(16S)基因的DNA条形码进行对比,对我国部分马、驴品种进行遗传多样性分析.本研究共生成了CYTB DNA条形码1271条,经分析,CYTB、CO Ⅰ 和16S的GC含量范围分别为44.4％～47.0％、38.3％～47.0％和40.9％～42.6％.对比后发现CYTB基因拥有最多的单倍型序列,在3个基因中表现出更多的多态性位点数,且单倍型多样性更高.编码蛋白的CYTB和CO Ⅰ基因的第3位密码子突变率更高,保守性最小,而非编码蛋白16S基因中3位密码子突变率没有显著差异.CYTB和CO Ⅰ蛋白序列的氨基酸含量不同,CYTB中含量最多的3个氨基酸为亮氨酸、异亮氨酸和苏氨酸,CO Ⅰ为亮氨酸、甘氨酸和丙氨酸.在CYTB和16S条形码中,无论是在物种水平上还是在亚种水平上,种内和种间距离都出现重合现象,而马和驴的COⅠ DNA条形码在种内/种间遗传距离上存在明显的条形码间隙,更适合进行物种进化分析.综上,构建的CYTB DNA条形码含有较多的遗传信息,结合CO Ⅰ和16S基因进行马、驴不同水平的遗传多样性分析具有一定的可行性.
线粒体DNA、DNA条形码、遗传多样性、马、驴
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S821.2(家畜)
国家重点研发计划2018YFC1200201
2023-02-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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