绵羊KIAA2012与UTP20多态、胴体品质性状关联与生物信息学分析
为探究KIAA2012和UTP20多态性与胸椎数间的关联性,筛选胸椎数相关重要分子标记,利用Sequenom MassARRAY?SNP技术检测苏尼特羊和小尾寒羊中与胸椎数相关候选基因KIAA2012和UTP20的单核苷酸多态性(SNPs)位点,开展群体遗传学分析,并与胸椎数进行关联分析;利用生物信息学分析工具对KIAA2012和UTP20的遗传特征进行分析.结果表明,UTP20g.170058254G>A位点在苏尼特羊群体中突变型(GA)胸椎数显著(P<0.05)高于野生型(GG),g.170053888G>A和g.170072471G>A在小尾寒羊和苏尼特羊中均与胸椎数没有显著相关;KI-AA2012 g.203440537A>G、g.203424302A>G、g.203440384A>T在小尾寒羊和苏尼特羊中与胸椎数均没有显著相关(P>0.05).SNPs与胴体长度分析结果表明,在小尾寒羊KIAA2012g.203440537A>G中,突变型(GA)胴体长度显著(P<0.05)高于野生型(GG).生物信息学分析表明,KIAA2012为亲水蛋白,UTP20为疏水蛋白,两者蛋白结构均不稳定,无跨膜结构域.综上所述,UTP20 g.170058254G>A位点与苏尼特羊胸椎数性状显著相关,KIAA2012 g.203440537A>G与小尾寒羊胴体长度性状显著相关,可作为调控绵羊胸椎数变异潜在的分子辅助标记.
KIAA2012、UTP20、SNPs、胸椎数、绵羊
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S826(家畜)
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;河北省自然科学基金青年项目;国家肉羊产业技术体系项目;中国农业科学院科技创新工程
2022-04-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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