山羊痘病毒G9和A16基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

为研究山羊痘病毒(goatpox virus,GTPV) G9、A16蛋白的功能,用PCR方法从山羊痘病毒弱毒疫苗毒株GTPV AV41中扩增出编码G9、A16蛋白的基因进行测序,通过生物信息学方法对目的基因序列进行分析.结果 显示:G9蛋白有34个磷酸化位点,17个抗原表位位点;二级结构中以α-螺旋和无规则卷曲为主,分别占36.61％和42.86％,有9个保守结构域,蛋白序列末尾有跨膜区域,包含15个半胱氨酸残基位点;三级结构中具有细胞凋亡和跨膜功能的结构.A16蛋白有36个磷酸化位点,19个抗原表位位点;二级结构中α-螺旋和无规则卷曲为主,分别占25.46％和48.28％,有10个保守结构域,蛋白序列末尾有跨膜区域,包含21个半胱氨酸残基位点;三级结构预测结果显示可以形成膜蛋白.上述研究结果为进一步探究GTPV的G9、A16蛋白功能提供了参考.

关键词：山羊痘病毒、G9蛋白、A16蛋白、生物信息学分析

所属期刊栏目：52

分类号：S855.3(动物医学（兽医学）)

资助基金：宁夏自然科学基金项目;宁夏自然科学基金项目

在线出版日期：2020-10-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：59-67