猪繁殖与呼吸综合征病毒华南株GDjm全基因组测序与遗传进化分析
为监测猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)基因变异情况,对广东地区某猪场患有猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)仔猪的肺脏样品进行检测及病毒分离,在猪肺泡巨噬细胞(PAM)上成功分离1株病毒并命名为GDjm株,然而分离的毒株不能感染Marc-145细胞.全基因组进化分析、同源性比对及重组分析结果显示,GDjm属于重组毒株,与GDZS2016的同源性为96.2%,与中国高致病性毒株HUN4同源性为96.0%,与美洲型经典毒株VR-2332的同源性为87.4%,与NADC30同源性为82%,与欧洲型毒株Lelysud-virus同源性为57.9%.NSP2序列比对和同源性分析结果显示,GDjm与高致病性毒株HUN4、JXA1、JXwn06相似,在511、534~562位存在氨基酸缺失.GP5序列比对以及同源性分析结果显示,GDjm毒株在GP5抗原表位存在氨基酸突变.经重组分析得出GDjm株为高致病性毒株HUN4与华南地区流行毒株GDZS2016的重组毒株,重组区域为6 723~9 521 bp、11 998~15 019 bp.
猪繁殖与呼吸综合征病毒、分离鉴定、遗传进化、重组
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S855.3(动物医学(兽医学))
国家重点研发计划;“十二五”国家科技计划农村领域项目;乡村振兴战略专项构建现代农业体系重大动物疫病防控技术研究和推广项目;广东省重点领域研发计划项目;广东省畜禽地方品种保护与研发利用提升工程
2020-07-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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