民猪与大白猪肠道菌群的比较研究
民猪是我国一个著名的地方猪种,属于脂肪型猪种.而大白猪起源于欧洲,是瘦肉型猪种.通过比较这2个不同猪种间肠道微生物菌群的差异,分析它们在消化吸收上的异同点.首先针对16S rDNA V4区设计引物,对来自于5头大白猪和5头民猪的粪便基因组进行PCR扩增,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行测序,数据经优化整理后,进行OTU聚类分析,并在门、纲、目、科和属共计5个水平上进行分类学统计.结果表明:共获得421～460 bp序列298 768条,占总数的99.98％.2组间共有OTU 885个,大白猪特有OTU 69个,民猪特有OTU 221个.共检测到25个门,其中拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、螺旋菌门(Spirochaetae)和变形菌门(Proteobacteria)占优势,民猪和大白猪之间具有大致相同的门水平分布.在检测到的207个属中,普氏菌属(Prevotella)和密螺旋体属(Treponema)的相对丰度值在2个猪种内均较高.而大白猪的厌氧弧菌属(Anaerovibrio)和梭菌属(Clostridium)分别比民猪猪高出4.5倍和3.4倍,民猪的纤维杆菌属(Fibrobacter)、螺旋体属(Spirochaeta)和密螺旋体属(Treponema)比大白猪分别高出3.7倍、1.6倍和1.7倍.由此推测,民猪肠道内纤维杆菌属的高表达可能与其易消化粗纤维饲料有关.
民猪、大白猪、16S rDNA、宏基因组测序
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S828(家畜)
留学人员科技活动项目择优资助项目;国家生猪产业技术体系岗位科学家CARS-37
2018-02-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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