不同物种LH-β基因的生物信息学分析

摘要：

为了研究不同物种LH-β基因的遗传多样性,采用生物信息学方法对LH-β基因进行了分析.从NCBI中选择了15个物种共73条LH-β基因编码区序歹,并对该基因的遗传多样性、氨基酸序列、信号肽、跨膜结构域、亲水性/疏水性、蛋白质二级和三级结构进行了预测和分析.结果表明:在15个物种的73条基因序列中共检测到687个多态位点,生成55个单倍型;突变位点总数为23到146个;物种间的核苷酸歧异度(Dxy)在0.030到0.275之间,遗传分化(Gst)在0.000到0.183之间,净遗传距离(Da)在0.007到0.264之间.LH-β编码的蛋白呈碱性,N端有信号肽,没有跨膜结构域,肽链表现为亲水性.蛋白质二级结构主要结构元件是α-螺旋、延伸链和不规则卷曲.

关键词：LH-β基因、生物信息学、蛋白特性、繁殖性状

所属期刊栏目：48

分类号：S813.1(普通畜牧学)

资助基金：河北省高等学校科学技术研究项目;河北省青年拔尖人才支持计划第一批

在线出版日期：2016-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：21-26