2011-2012年我国部分地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异分析
应用RT-PCR方法对江苏、安徽、山东、江西、河北、上海、北京等省市的146份腹泻仔猪的小肠组织和粪便样本进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测.结果:146份腹泻病料中共检出82份PEDV阳性样品,阳性率为56.2%;对其中14份阳性病料的ORF3基因进行测序,将所测序列与GenBank中PEDV参考毒株的ORF3序列进行分析比较,并绘制了系统进化树.所测14个PEDV ORF3序列与GenBank中的38个参考毒株ORF3核苷酸序列同源性为93%~ 100%;ORF3基因系统进化树分析表明PEDV分为3组,13个病毒属于PEDV3组,另外1个属于PEDV 1组.ORF3遗传变异分析表明:中国最近流行的PEDV野毒株与韩国野毒株关系密切,但与欧洲株以及中国目前使用的疫苗株基因差异较大.
猪流行性腹泻病毒(PEDV)、ORF3基因、遗传变异
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S852.65;S858.28(动物医学(兽医学))
江苏省农业科技自主创新项目CX123076
2014-04-16(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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