产蛋初期和后期蛋鸡胫骨转录谱的构建及骨代谢相关基因分析

摘要：

旨在通过分析产蛋初期和产蛋后期蛋鸡胫骨转录表达谱筛选与胫骨骨代谢相关的候选基因,以揭示蛋鸡骨代谢变化的遗传机制.本研究选择19周龄(产蛋初期)和79周龄(产蛋后期)的海兰灰蛋鸡各3只,构建胫骨转录组文库,利用转录组数据筛选差异表达基因并预测蛋白质互作关系;随机选择5个差异表达基因,利用实时荧光定量PCR验证其表达水平.构建的6个海兰灰蛋鸡胫骨cDNA文库中获得有效读数19 034 718～22 668 315条,Q30值至少为93.68%,比对率为83.78%～85.72%.筛选出产蛋初期和产蛋后期蛋鸡胫骨差异表达基因共1 211个,其中645个基因下调,566个基因上调.GO功能富集分析结果显示,差异表达基因主要富集在细胞分化和细胞发育等过程.KEGG分析发现,差异表达基因显著富集在11条通路(P<0.05),其中5条与骨代谢相关,包括MAPK信号通路、TGF-β信号通路、Toll样受体信号通路、糖胺聚糖生物合成-硫酸软骨素/硫酸皮肤素和糖胺聚糖降解.在上述5条通路中涉及59个差异表达基因,其中29个上调,30个下调.此外,对骨代谢相关通路中的59个差异表达基因进行蛋白互作分析,共鉴定出53个编码蛋白,筛选出5个hub基因(IL6、IL1B、FOS、TGFB2和BMP4).从1 211个差异表达基因中随机选取5个差异表达基因进行实时荧光定量PCR验证,结果与转录组测序结果一致.本研究揭示了产蛋初期和产蛋后期蛋鸡胫骨组织中的基因表达差异,筛选到多个影响蛋鸡胫骨骨代谢的差异表达基因和信号通路,为研究调控蛋鸡胫骨组织骨代谢的分子机制提供理论依据.

关键词：蛋鸡、胫骨、差异表达基因、骨代谢

所属期刊栏目：54

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：国家自然科学基金;河北省重点研发计划项目;河北省鸡现代种业科技创新团队;河北省现代农业产业技术体系创新团队蛋鸡肉鸡良繁体系与品种培育岗位

在线出版日期：2023-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：4164-4173