鸡胚心脏组织转录组数据鉴定雪域白鸡高原低氧适应性关键基因

摘要：

旨在通过分析白来航(White Leghorn,WL)和雪域白鸡(Xueyu White chicken,XYW)在低氧条件下孵化时胚胎心脏组织的基因表达差异,挖掘鸡胚低氧适应候选基因.本研究在高海拔环境孵化雪域白鸡和白来航鸡种蛋,采集孵化第16 天胚胎心脏组织,提取RNA,进行转录组测序(RNA-seq),筛选差异表达基因(DEGs),并对其进行荧光定量PCR(qRT-PCR)验证、功能富集分析和构建转录因子-靶基因调控网络,鉴定与雪域白鸡低氧适应相关的候选基因.在雪域白鸡和白来航鸡的心脏组织之间筛选到253个DEGs,随机选择5个DEGs进行qRT-PCR验证,表达趋势与测序结果一致.功能富集分析表明,DEGs主要涉及心血管发育和心脏功能相关的生物学过程和信号通路.将DEGs和已知的鸡转录因子对比,筛选到FOXP2和HOXA2,参与调控血管生成、心肌收缩等,对雪域白鸡胚胎低氧适应起关键作用.本研究通过鸡胚心脏组织转录组数据分析,鉴定到TENM2、NOG、SMOC1、CCBE1等鸡胚高原低氧适应候选基因,为解析雪域白鸡高原低氧适应分子机制提供理论依据.

关键词：雪域白鸡、白来航鸡、低氧适应、心脏、转录组

所属期刊栏目：54

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：西藏自然科学基金项目;现代农业产业技术体系

在线出版日期：2023-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：4154-4163