2021-2022年我国部分地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因变异分析

摘要：

为深入了解我国猪繁殖与呼吸综合征病毒(porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)的流行和遗传变异情况,2021-2022年,本课题组在我国13个省份约50个养殖场收集了 117份临床疑似猪繁殖与呼吸综合征患猪样品,针对PRRSV的ORF5基因进行了遗传变异分析.通过实时荧光定量PCR鉴定PRRSV阳性样品和基因型,应用RT-PCR扩增PRRSV ORF5和ORF7基因,将阳性样本进行测序并开展系统发育学分群和GP5氨基酸突变分析.结果显示,共检出PRRSV-2阳性样品48份(总体阳性率约41％),经测序共获取38条ORF5序列和10条ORF7序列.所有ORF5序列间核苷酸相似性为77.1％～99.8％,ORF7序列间核苷酸相似性为83.3％～98.7％.系统发育学分群显示,谱系1占比60％(29/48,28株NADC30-like毒株,1株NADC34-like毒株),谱系3占比25％(12/48),谱系5.1占比5％(2/48),谱系8.7占比10％(5/48).GP5氨基酸分析表明,信号肽(aa 1-26)、中和表位C(aa 52-61)及潜在的N-糖基化位点(aa 32-35、aa 44、aa 51)3个区域氨基酸存在显著变异.研究结果表明:多个谱系PRRSV同时在我国流行,谱系1已替代谱系8.7成为主要流行谱系,并分布于我国大多数省份;谱系3仅次于谱系1,主要在华南局部地区流行;谱系8.7毒株检出率较低.需要注意的是,在广东省惠州市检出1株NADC34-like毒株,说明该毒株可能已在华南地区潜在流行.近几年来,PRRSV在我国的流行日趋复杂,谱系1毒株的广泛流行增加了 PRRSV的遗传多样性.本研究结果将为制定PRRSV防控策略提供参考.

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒、ORF5、系统发育学分析、NADC30、NADC34

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分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金;茂名实验室科研启动项目;现代农业产业技术体系

在线出版日期：2023-10-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：3812-3823