北京黑猪FABP3和SCD基因多态性与肉品质性状关联分析

摘要：

旨在研究脂肪酸结合蛋白-3(fatty acid binding protein 3,FABP3)和硬脂酰基辅酶A脱氢酶(stearoyl-CoA desaturase,SCD)基因的多态性及其与肉品质性状的关联,从而能够在分子水平上指导北京黑猪的育种工作.本研究以413头北京黑猪为材料,收集肉品质性状数据并提取DNA和RNA,根据FABP3和SCD基因序列设计20对引物进行PCR扩增及测序,运用DNAStar软件分析测序结果,对FABP3和SCD基因进行不同基因型与北京黑猪肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)含量的关联分析并运用荧光定量PCR对其进行基因表达差异分析.结果发现,FABP3基因存在1个错义突变(c.681A＞G),SCD基因存在1个错义突变、2个同义突变以及2个3'UTR区突变.使用Duncan's多重检验统计分析发现,SCD基因内的SNPs与肉品质性状关联均不显著;FABP3基因错义突变位点c.681A＞G与肉色L* 和IMF含量显著关联(P＜0.05).该错义突变导致FABP3蛋白第51位氨基酸残基由异亮氨酸(I)突变为苏氨酸(T).利用qPCR开展FABP3 c.681A＞G两种纯合基因型(AA和GG)个体表达量差异分析,发现该突变位点两种纯合基因型个体间基因表达量差异不显著,说明FABP3 c.681A＞G错义突变位点可能通过影响蛋白功能来调控肌内脂肪含量和肉色L* 性状.上述两个基因中只有1个位点与肉色L*和IMF含量关联显著,可以作为北京黑猪肉品质性状的候选基因功能位点,也能为北京黑猪肉品质育种提供了新的分子标记.

关键词：北京黑猪、FABP3、SCD、肉品质、关联分析

所属期刊栏目：54

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：国家重点研发计划;国家生猪产业技术体系项目;中国农业科学院科技创新工程

在线出版日期：2023-04-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：966-975