两广小花猪FOXL2基因多态性及其与几个重要经济性状的关联分析

摘要：

旨在筛选FOXL2(forkhead box protein L2)基因与猪排卵状态和屠宰性状相关的SNPs位点,为今后两广小花猪分子育种和遗传改良提供理论和参考依据.本研究以107头(365±25)日龄两广小花猪为研究对象,使用靶向测序基因型检测(genotyping by target sequencing,GBTS)技术定位FOXL2基因的SNPs位点,对排卵状态、乳头数和屠宰性状进行关联分析和单倍型分析.两广小花猪FOXL2基因共检测到24个突变位点.剔除InDel突变和突变频率小于1％的SNP位点后,对得到的12个SNPs进行关联分析,其中2个位于编码区、10个位于非编码区.单 SNP 位点关联分析表明,g.79706726 T＞C、g.79706898 C＞T、g.79707794 T＞C、g.79709005 T＞C这4个位点对排卵状态均有显著性影响(P＜0.05),对总乳头数性状无显著性影响(P＞0.05).g.79707040 A＞G、g.79708079 T＞C、g.79708152 G＞T、g.79706726 T＞C、g.79706898 C＞T、g.79707794 T＞C 这 6 个 SNPs 位点对骨重、瘦肉率、腿臀重、左胴体重性状均有显著性影响(P＜0.05),其中3个SNPs位点g.79707040 A＞G、g.79708079 T＞C、g.79708152 G＞T对板油重性状有显著性影响(P＜0.05).SNP位点单倍型组合关联分析发现,g.79706726 T＞C、g.79706898 C＞T、g.79707794 T＞C 这 3 个位点处于强连锁区域内(r2＞0.9).H1H2 单倍型组合(g.79706726 T＞C和g.79706898 C＞T)对排卵状态、骨重、瘦肉率、腿臀重、左胴体重性状均有显著性影响(P＜0.05),其中CCTT单倍型个体的骨重、腿臀重和左胴体重性状显著高于TTCC单倍型个体(P＜0.05),CCTT单倍型个体的瘦肉率性状显著低于TTCC单倍型个体(P＜0.05).FOXL2基因中有与排卵状态显著相关的g.79706726 T＞C、g.79706898 C＞T、g.79707794 T＞C、g.79709005 T＞C 等 SNPs 位点.另外,本研究发现了 FOXL2转录因子与猪屠宰性状相关的SNPs位点,表明FOXL2转录因子除了维持卵巢表型和功能以外,还影响猪的重要经济性状.本研究为FOXL2基因在两广小花猪的选种选育中提供重要参考,为分子标记辅助选择提供理论依据.

关键词：卵巢、屠宰性状、FOXL2、SNPs、单倍型

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分类号：S828.2(家畜)

资助基金：广东省重点领域研发计划;现代农业产业技术体系;国家自然科学基金;广东省自然科学基金项目;广州市科技计划项目

在线出版日期：2023-04-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：956-965