大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂与腹脂脂质代谢差异基因及调控网络分析

摘要：

旨在筛选大型迪庆藏猪不同生长阶段、不同部位脂质代谢差异的关键基因.本研究选择胎次相同、出生日期相近、体重10 kg左右的大型迪庆藏猪36头,随机分为3组,相同条件育肥,分别在平均体重达40、80和120 kg时屠宰,测定胴体性能,每组采集3头猪的背脂和腹脂进行高通量转录组测序,测序数据经拼接、比对,筛选与脂质代谢相关的显著差异基因并进行GO、KEGG分析、基因互作网络分析.结果表明,40、80和120 kg大型迪庆藏猪腹脂vs.背脂分别筛到486、765和339个差异表达显著基因,随机挑选的EGR2、SOD3等5个差异表达显著基因的qPCR结果与转录组测序结果一致,差异表达显著基因主要富集在肌肉收缩、细胞黏附、间充质细胞增殖正调节等GO条目,心肌收缩、PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路等KEGG通路;40 kg组EGR2、RARRES2、TMOD4和SFRP2基因位于网络核心,EGR2、RARRES2、SFRP2在腹脂上调,TMOD4下调;80 kg组THBS1、PPARA、NRIP1和LPL基因位于网络核心,4个核心基因均在腹脂上调;120 kg组HTRA1、TSHR、LRRK2、STC2、SHOX2和SOD3基因位于网络核心,LRRK2、TSHR在腹脂上调,SHOX2、SOD3、STC2、HTRA1下调.结果提示,EGR2、THBS1、TSHR等14个基因作为核心基因精细调控大型迪庆藏猪不同生长阶段背脂与腹脂脂质代谢,10～40 kg,EGR2等4个基因位于核心,促进脂肪细胞分化、增殖的基因在腹脂上调,脂肪合成的开关基因下调;40～80 kg,THBS1等4个基因位于核心,促进甘油三酯合成、胆固醇形成、脂质积累的基因在腹脂上调;80～120 kg,LRRK2等6个基因位于核心,促进甘油三酯积累、脂肪酸氧化的基因在腹脂上调,抑制脂肪分解、脂滴形成的基因下调.本试验结果可为解析地方猪不同部位脂质差异性沉积的调控机制提供基础数据,为迪庆藏猪的靶向选育提供参考.

关键词：迪庆藏猪、脂肪差异沉积、功能基因、基因互作网络

所属期刊栏目：54

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：云南省乡村振兴科技专项项目;云南省重大科技专项项目;云南省农业联合面上项目

在线出版日期：2023-03-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：520-533