北京黑猪FUBP3和USP43基因多态性与眼肌面积性状的关联分析

摘要：

旨在研究上游远端元件结合蛋白3(far upstream element binding protein 3,FUBP3)及泛素特异性蛋白酶43(ubiquitin specific protease 43,USP43)基因多态性与北京黑猪眼肌面积性状的关系,从而在分子水平指导北京黑猪的育种工作.本研究选取408头北京黑猪收集眼肌面积性状数据并采集肉样提取DNA,根据FUBP3和USP43基因序列设计43对引物进行PCR扩增及测序,运用DNAstar软件分析测序结果,对FUBP3和USP43基因不同基因型与北京黑猪眼肌面积性状进行关联分析并运用荧光定量PCR对两基因进行基因表达差异分析.在FUBP3基因启动子区共有8个突变,其中rs701769847G＞A与5～6肋眼肌面积和最后肋眼肌面积均关联显著(P＜0.05),rs332131528C＞G 仅与 5～6 肋眼肌面积关联显著(P＜0.05),rs325550799T＞C、rs339464012T＞C 和rs326069041T＞C只与最后肋眼肌面积关联显著(P＜0.05);基因表达差异分析表明,rs701769847G＞A位点GG型个体的FUBP3基因mRNA水平显著低于AA型个体(P＜0.05).USP43基因启动子区的rs335310752C＞T和剪切区的rs323463345G＞A均只与最后肋眼肌面积关联显著(P＜0.05).基因表达差异分析表明,rs323463345G＞A中GG型个体和AA型个体的USP43基因mRNA水平差异不显著.上述两基因中共有两个位点与5～6肋眼肌面积性状关联显著(P＜0.05),6个位点与最后肋眼肌面积性状关联显著(P＜0.05),可以作为北京黑猪眼肌面积性状变异的候选基因功能位点,也可以作为潜在的眼肌面积性状分子标记.

关键词：北京黑猪、FUBP3、USP43、眼肌面积

所属期刊栏目：53

分类号：S828.2(家畜)

资助基金：国家重点研发计划;中国农业科学院科技创新工程;国家生猪产业技术体系项目

在线出版日期：2023-01-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：4197-4206