10.11843/j.issn.0366-6964.2022.08.035
基于网络药理学研究板蓝根抑菌活性成分及其作用机制
旨在基于网络药理学研究板蓝根的主要抑菌药效成分及其作用机理.利用中药系统药理学在线分析数据库(TCMSP)筛选出板蓝根药效成分及其潜在作用靶点,通过0MIM和GeneCards数据库以"抑菌"为关键词搜索相关靶点.通过Venny平台获取板蓝根和抑菌的交集靶点.通过STRING数据库结合Cytoscape软件构建PPI网络图并筛选关键靶点.通过DAVID数据库进行GO功能富集和KEGG通路富集分析.通过Autodock Tools 1.5.7软件将关键药效成分和抑菌靶点进行分子对接.通过菌落计数法和SDS-PAGE法验证关键药效成分抑菌作用和作用靶点.结果显示:共筛选到药效成分33个,药物靶点61个,抑菌靶点2 192个,药物与抑菌作用交集靶点32个.蛋白互作网络分析发现,TNF、TP53、CASP3、JUN、ESR1、PTGS2等30个蛋白可能是板蓝根抑菌作用的关键靶点.GO功能富集分析得到126个条目,包括生物过程条目86个(如对雌二醇的反应、凋亡信号通路、神经元凋亡过程的正调控),细胞组分条目11个(如细胞质、核),分子功能条目29个(如蛋白质同源二聚化活性、酶结合).KEGG通路富集分析得到20条通路.分子对接结果显示,度值排名前3位的活性成分(β-谷甾醇、豆甾醇、金合欢素)与关键抑菌靶点编码蛋白的结合能均<0 kJ·mol-1.抑菌试验验证表明,豆甾醇是板蓝根的关键药效成分,其能够下调胞内CASP3和PTGS2蛋白的表达.板蓝根主要通过药效成分豆甾醇作用于PTGS2、CASP3靶点,通过TNF、癌症途径信号通路发挥抑菌作用.
板蓝根、网络药理学、抑菌活性、作用机制
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S853.74(动物医学(兽医学))
中国农科院创新工程联合攻关重大科研任务CAAS-ZDRW202111
2022-09-14(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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