基于TMT技术对低氧与常氧条件下耗牛PASMCs的蛋白组学分析

摘要：

旨在利用串联质谱标签(tandem mass tag,TMT)技术对牦牛肺动脉平滑肌细胞(pulmonary arterial smooth muscle cells,PASMCs)在低氧和常氧不同培养条件下的蛋白组学进行差异表达蛋白(differentially ex-pressed proteins,DEPs)分析,进而了解高原牦牛PASMCs的DEPs.本试验采用贴壁培养法培养PASMCs,分别在低氧与常氧条件下培养72 h,然后收集细胞,提取两组细胞的总蛋白,利用TMT标记蛋白定量技术筛选DEPs进行分析,并进行GO功能注释和KEGG通路分析.在比较低氧和常氧下PASMCs的2组蛋白样品中共获得6 859个蛋白,以FC(fold change)≥1.3或≤0.78,且P＜0.05条件进行筛选,获得DEPs共531个,其中上调DEPs有186个,下调DEPs有345个.富集分析结果表明,DEPs主要富集在中枢碳代谢、糖酵解与糖代谢合成、HIF-1信号通路、次生代谢产物的生物合成等低氧适应相关通路中.在这些通路中发现其中有7个重要的DEPs(PGK、HK、LDH、PGAM、pfkA、IL6ST、PDK1).亚细胞定位中质膜(28.9％)所占比例最高.结构域分析中主要以表皮生长因子样结构域为主.结果表明,DEPs分别富集在代谢、酶活性、低氧适应性等相关类别与通路中,并发现7个重要的DEPs(PGK、HK、LDH、PGAM、pfkA、IL6ST、PDK1)可能与缺氧环境的适应有关.这些结果为进一步研究牦牛PASMCs在低氧中的适应性提供了理论支持.

关键词：牦牛、PASMCs、低氧与常氧、TMT技术

所属期刊栏目：53

分类号：S823.85(家畜)

资助基金：国家自然科学基金;甘肃省自然科学基金;中央高校创新团队项目;教育部长江学者和创新团队发展计划项目

在线出版日期：2022-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：2182-2193