猪流产胎儿中猪圆环病毒3型的检测及其遗传演化分析

摘要：

旨在分析猪流产胎儿中猪圆环病毒3型(porcine circovirus type 3,PCV3)的感染及其遗传进化情况.对2015-2017年采集的湖南省680份猪流产胎儿病料样品进行PCV3检测、扩增和测序,并利用生物信息学软件对获得的序列进行遗传进化分析.结果显示,猪流产胎儿样品中PCV3阳性率为24.4％(166/680),其中,2015-2017年阳性率分别为18.2％(26/143)、22.7％(54/238)和28.8％(86/299).从PCV3阳性样本中获得了 1株PCV3基因组全长序列,命名为PCV3/CN/Hunan-57(GenBank序列登录号为MZ934695),与国内外毒株基因组序列相比,相似性为97.8％～99.2％;获得了 5株PCV3 ORF2基因序列,它们的核苷酸和氨基酸相似性为97.5％～98.3％和96.7％～99.7％,与国内外参考毒株ORF2基因序列相比,其核苷酸和氨基酸相似性为96.3％～99.2％和96.8％～100％.基于ORF2基因序列构建遗传进化树和进行多重序列比对,发现获得的PCV3阳性序列分别属于PCV3a(1株)和PCV3c(4株),并鉴定出T100A、G113S和A184S突变位点.综上表明,猪流产胎儿中PCV3感染率较高,且存在不同类型的PCV3毒株感染,为后续深入研究PCV3遗传变异及其相关致病性提供了重要参考信息.

关键词：猪圆环病毒3型、全基因组、Cap、遗传演化分析

所属期刊栏目：53

分类号：S852.659.2(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金;湖南省自然科学基金面上项目;湖南农业大学双一流建设项目

在线出版日期：2022-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1527-1535