转录组测序筛选山羊妊娠早期胚胎附植相关基因

摘要：

旨在通过胚胎附植前、后的山羊子宫角组织高通量测序筛选妊娠早期胚胎附植的关键基因.本研究选取2～4岁体重相近((44.76±3.49)kg)的经产努比亚母山羊16只,在同期发情-人工输精配种后的第15(D15)和第30天(D30)分别随机选取3只羊颈动脉放血处死.采集子宫角组织利用Illumina HiSeq进行高通量转录组测序(RNA-Seq),筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)并对DEGs进行功能注释,基因功能查询进一步筛选与胚胎附植直接相关的调控基因,荧光定量PCR(qRT-PCR)对筛选的基因进行表达量验证分析.D15和D30子宫角组织转录本比较分析发现了 2 000个DEGs,其中上调基因620个,下调基因1 380个.GO功能聚类分析共分为3大类52组,其中细胞组分17组,生物过程23组,分子功能12组,获得细胞连接与增殖,生物粘附与调节,分子活性与转导等重要生物途径.以D15表达量高低为排序标准,从表达量最高的10个基因中筛选出了与胚胎附植有关的基因MGP和TAGLN;从上调和下调幅度最大的前10个差异表达基因中,获得参与妊娠相关糖蛋白合成与分泌的基因PAG-3、PAG-8、PAG-12,参与生长因子结合与生长激素释放激素受体活性相关基因GH-RHR和胰岛素样生长因子结合蛋白基因IGFBP1.qRT-PCR结果显示,随机选取的6个基因在D15和D30子宫角中表达变化趋势与RNA-Seq结果一致.获得的基因MGP、TAGLN、PAG-3、PAG-8、PAG-12、GHRHR、IG-FBP1在努比亚山羊胚胎附植中具有重要作用.

关键词：努比亚山羊、妊娠早期、子宫角、胚胎附植、转录组测序

所属期刊栏目：53

分类号：S827.3(家畜)

资助基金：国家自然科学基金;国家重点研发计划;贵州省农业科学院青年英才培育项目;贵州省肉羊产业技术体系黔牛羊领发号

在线出版日期：2022-06-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1465-1474