反刍动物瘤胃噬菌体的宏基因组学研究方法及进展

摘要：

病毒(virus)存在于各种动物胃肠道中,反刍动物瘤胃也不例外.瘤胃是一个复杂且多样的微生态系统,包括细菌、真菌、原虫、古生菌和病毒等多种微生物.目前,多组学技术和生物信息学分析手段被广泛用于瘤胃细菌群落的研究.有研究表明,饲粮、环境及宿主基因型会对瘤胃细菌多样性和菌群结构产生影响;瘤胃细菌也会反过来影响宿主机体代谢、生长发育和健康状况.与瘤胃细菌相比,瘤胃病毒受到的关注相对较少.随着分子生物学技术的发展,高通量测序技术为病毒组学的研究提供了必要的支持.研究者们将宏基因组学运用于瘤胃病毒,在瘤胃液中发现了许多新型病毒,极大地丰富了人们对瘤胃病毒多样性的认知.本文从瘤胃噬菌体概念出发,重点阐述了瘤胃病毒DNA提取、测序及生物信息学分析手段,并结合其他环境病毒的研究方法进行探讨,最后对瘤胃病毒宏基因组研究的应用前景进行了总结.

关键词：瘤胃;病毒;噬菌体;宏基因组;高通量测序

所属期刊栏目：53

分类号：S852.65(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;国家重点研发计划;国家重点研发计划;兰州大学双一流建设人才项目

在线出版日期：2022-03-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：20-31