检测山羊嵴病毒的实时荧光定量PCR方法的建立和应用

摘要：

山羊嵴病毒(caprine kobuvirus,CKoV)是国内山羊新发病毒,本试验目的是建立检测CKoV的实时荧光定量PCR方法,并对西南三省腹泻山羊粪样进行该病毒的检测.选择CKoV最保守的3D基因序列,设计3D基因引物,初步设计实时荧光定量PCR,经优化反应条件和反应体系,成功建立了检测CKoV的TB Green染料法实时荧光定量PCR方法.该方法在病毒浓度2.23×102～2.23×108 copies· μL-1范围内线性关系良好,相关系数为0.9992,扩增效率为110％;此方法具有良好的特异性和稳定性,最低检测限为2.23×101 co pies·μL-1.采用所建立的方法对2020年1—4月采集自四川、云南和重庆的共15个场79份山羊腹泻粪样本进行检测,结果CKoV的平均检出率为25.3％,场阳性率为53.3％.并且本试验获得了13个完整的CKoV 3D基因,遗传进化分析表明这13个3D基因具有独特的进化趋势.本研究为CKoV的分子检测提供了一种新的技术手段和基础流行病学数据.

关键词：山羊嵴病毒、实时荧光定量PCR方法、山羊、腹泻

所属期刊栏目：52

分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家重点研发计划;西南民族大学新发动物疫病创新团队;动物医学四川省高等学校重点实验室平台项目

在线出版日期：2021-06-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1349-1358