基于全基因组重测序技术的狮头鹅Indel标记分析

摘要：

旨在利用重测序技术分析狮头鹅基因Indel差异并探讨其产蛋调控通路.本研究选用产蛋量有差异的成年狮头鹅和吉林白鹅母鹅各5只,采用全基因组重测序方法,对两个品种基因组水平的插入缺失突变情况进行比较分析.结果表明,测序共得到350.35 Gb数据,其中Q20与Q30平均值分别为96.74％、92.19％;通过注释分析发现了 748 821.2个Indel变异位点.10只试验鹅的Indel位点在编码区(CDS)的分布趋势和数量与参考基因组相似,其中有11 737个Indel位点导致了插入或删除;在此基础上,进一步分析筛选产蛋相关通路,发现在GnRH信号通路、雌激素信号通路、催产素信号通路、催乳素信号通路以及孕酮介导的卵母细胞成熟通路中分别有15、1、1、1、18个变异基因参与狮头鹅产蛋调控.结果显示,通过Indel位点分析表明,GnRH信号通路、雌激素信号通路、催产素信号通路、催乳素信号通路和孕酮介导的卵母细胞成熟通路均与狮头鹅产蛋有关,并进一步筛选出可能的产蛋相关基因.这些数据将为我们研究狮头鹅繁殖性能提供有效基础和依据.

关键词：狮头鹅、重测序、Indel、信号通路、产蛋

所属期刊栏目：52

分类号：S835.2(家禽)

资助基金：广东省现代农业产业技术体系创新团队2019KJ137

在线出版日期：2021-05-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共14页

页码：662-675