2015—2017年我国部分地区猪非典型瘟病毒的遗传变异分析

摘要：

猪非典型瘟病毒(atypical porcine pestivirus,APPV)是一种能引起仔猪先天性震颤的病原.为了解我国APPV感染状况、基因组以及遗传变异特征,采用套式RT-PCR方法,对2015—2017年我国22个省(自治区、直辖市)93个猪场的285份血清样本进行了APPV核酸检测和E2基因序列分析;并对发病猪组织样本进行了APPV全基因组扩增与序列测定和遗传变异分析.结果显示,检测样本的APPV阳性率为25.26％(72/285,95％CI=20.3％ ～30.7％),且阳性率逐年升高;猪场APPV阳性率为38.71％(36/93,95％CI=59.7％ ～94.8％).扩增出的35条A PPV E2基因的核苷酸序列相似性为83.4％ ～100.0％,推导氨基酸序列相似性为90.5％ ～100.0％.基于E2基因的遗传变异分析显示,APPV临床毒株可被分为4个亚群,大多数国内APPV临床毒株可归入亚群1,与美国的000515株遗传关系较近;少数临床毒株与Bavaria S5/9、NL1 Farm1等欧美毒株同属于亚群2;6条测定序列被划分至亚群3;亚群4的成员均来自广东;其中亚群3与亚群4均由国内APPV临床毒株构成.全基因组序列遗传变异分析表明,全球APPV毒株可归为2大分支,本研究中测序的毒株CHheb1701与所有国外毒株属于同一分支,且与GX04/2017遗传关系最近,与美国毒株000515同聚为一簇;而第二分支中的毒株均来自我国广东省.以上研究表明,我国猪群中A PPV感染已较为普遍,毒株多样且变异广泛,同时,也提示毒株可能有不同的来源,为进一步开展A PPV的防控及相关研究奠定了重要基础.

关键词：猪非典型瘟病毒、E2基因、遗传变异分析

所属期刊栏目：51

分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：现代农业产业技术体系专项资金;国家重点研发计划

在线出版日期：2020-09-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1939-1948