四株分离自同一猪场的H3N2亚型猪流感病毒的进化分析

摘要：

猪作为流感病毒异源毒株间发生基因重组的“混合容器”,其呼吸道上皮细胞上同时存在着能够感染人(SA α-2,6-Gal)和禽(SA α-2,3-Gal)两种流感病毒的受体,具备产生新型流感病毒的潜力.在我们的前期研究中,连续两年(2013年和2014年)从南宁地区某个规模化养猪场当中分离获得了2株新型甲型流感病毒重配的H3N2亚型猪流感病毒(swine influenza viruses,SIVs).为了解SIVs在同一地方的遗传进化规律,我们在2018年至2019年间对该猪场进行了持续的监测,并于2019年再次成功分离获得了2株H3N2亚型的三源重组毒株,命名为A/swine/Guangxi/JG13/2019(简称JG13/2019)和A/swine/Guangxi/JG20/2019(简称JG20/2019).遗传进化分析表明其基因重配形式与2013年分离株A/swine/Guangxi/JGB4/2013(简称JGB4/2013)和2014年分离株A/swine/Guangxi/JG1/2014(简称JG1/2014)相同,表面基因HA和NA来源于类人H3N2谱系,内部基因NP、M、PA、PB1和PB2来源于2009年甲型H1N1大流感谱系(pdm/09H1N1),NS基因来源于古典型H1N1谱系.此外,新分离株JG13/2019和JG20/2019同早期分离株JGB4/2013和JG1/2014 HA和NA基因的核苷酸相似性分别为95.3％～97.4％和93.9％～97.0％,内部基因(NP、M、PA、PB1和PB2)的核苷酸相似性为96.2％～98.1％,NS基因的核苷酸相似性为97.1％～97.6％.通过分析比较这些年代不同毒株之间的关键氨基酸位点差异,结果发现JG20/2019和JG13/2019的HA蛋白仍旧保持了与人型受体结合的分子特征(190D、226I和228S),却也出现了V223I或P227S的新变化,JG13/2019的PA蛋白(R356K)和PB2蛋白(1588T)也与之前的毒株有所不同.这些位点上的氨基酸改变是否影响到病毒的致病能力、复制能力以及跨种间传播能力,有待今后进一步研究.历经6年,携带有pdm/09 H1N1多种内部基因片段(PB2、PB1、PA、M、NP)和类人表面基因(HA和NA)的H3N2亚型SIVs依旧在同一个猪场的猪群中流行,虽然其关键的功能区域出现了基因突变,但是仍然保持着能够感染人的受体结合特性.因此,加强对SIVs流行情况的监测,将为今后防控人类流感大暴发提供预警.

关键词：H3N2亚型、猪流感病毒、进化分析、分子特征

所属期刊栏目：51

分类号：S852.659.5(动物医学（兽医学）)

资助基金：广西自然科学基金青年基金项目;广西自然科学基金联合资助培育项目;广西创新驱动发展专项资金项目

在线出版日期：2020-05-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：801-809