RNA-Seq分析baeSR和acrB对鼠伤寒沙门菌相关毒力基因表达的影响

摘要：

本研究旨在探索baeSR和acrB基因缺失后对鼠伤寒沙门菌相关毒力基因表达的影响.采用RNA-Seq技术筛选鼠伤寒沙门菌体外诱导环丙沙星耐药株(CR)、acrB基因缺失株(CR△acrB)、baeSR和acrB基因双缺失株(CR△baeSR△acrB)的差异表达基因,对筛选的基因进行GO富集和KEGG通路富集分析,进一步探究差异表达基因的主要功能及涉及的生物过程,并选出7个差异显著基因进行荧光定量PCR验证.结果 表明CR△acrB与CR相比较,共筛选到1 320个差异表达基因(fold change的绝对值＞2,Q-value＜0.005),其中上调426个,下调894个;CRAbaeSRAacrB与CR相比较,共筛选到1 377个差异表达基因(fold change的绝对值≥2,Q-value＜0.005),其中上调405个,下调972个,两个比较组筛选到的毒力相关基因均主要富集在双组分系统、鞭毛组件、沙门菌感染和上皮细胞的细菌入侵等通路中.荧光定量PCR验证结果与RNA-Seq结果基本一致.本研究对baeSR和acrB基因在鼠伤寒沙门菌毒力中的作用进行了初步分析和探索,为进一步研究鼠伤寒沙门菌致病机制奠定基础.

关键词：鼠伤寒沙门菌、RNA-Seq、baeSR、acrB、荧光定量PCR

所属期刊栏目：50

分类号：R378.22(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)

资助基金：国家自然科学基金31772802;安徽高校自然科学重点研究项目KJ2017A132

在线出版日期：2019-12-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2318-2325