湖羊卵巢不同发育阶段的miRNA鉴定与分析

摘要：

旨在分析不同发育阶段绵羊卵巢组织中miRNA的表达水平,了解miRNA表达及其调控机理.本研究采用转录组测序技术鉴定1和8月龄湖羊卵巢组织中的miRNA,运用生物信息学方法对差异表达的miRNA进行靶基因预测,并对靶基因进行GO和KEGG功能注释,筛选参与卵巢发育的miRNAs.结果 显示,6个样品中检测到的已知miRNA个数分别为2 186、2 091、2 217、2 136、2 176、2 088,新miRNA的个数分别为613、567、668、640、662、450.筛选到701个差异表达novel miRNAs,38个差异表达已知miRNAs.对差异表达miRNAs的靶基因进行GO和KEGG分析,发现主要富集在血管内皮生长因子通路和卵巢类固醇生成等过程.对3个差异miRNAs进行qRT-PCR验证,与测序结果一致.oar-let-7b、oar-miR-29a、oar-miR-134-3p、oar-miR-541-3p等的靶基因富集在TGF-beta通路、卵巢卵泡生长等与卵巢发育相关的生物过程.oar-miR-148a、oar-miR-136的靶基因调控颗粒细胞增殖和类固醇生成,可能参与调控绵羊卵巢发育.

关键词：miRNA、卵巢、发育、功能注释、绵羊

所属期刊栏目：50

分类号：S826.3(家畜)

资助基金：转基因生物新品种培育重大专项2009ZX08008-004,2008ZX08008-003;农业科技创新工程ASTIP-IAS05;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项Y2016JC22,Y2018PT68

在线出版日期：2019-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1396-1404