新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式初探

摘要：

旨在初步分析新鲜及玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化模式.本研究采用单细胞全基因组甲基化测序技术(scWGMS)检测新鲜、玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚全基因组甲基化水平和差异甲基化区域(DMR),探讨两者之间DNA甲基化水平上的差异.结果 表明,新鲜卵母细胞体外受精囊胚的整体甲基化水平显著高于玻璃化冷冻卵母细胞体外受精囊胚的整体甲基化水平(P＜0.05).采用基因本体分析(GO)和相关信号通路(KEGG)对143个DMRs分析,发现生物学过程主要显著富集在新陈代谢、生长发育、细胞定位、细胞刺激反应等,通路主要富集在生长发育、核酸结合及组蛋白乙酰化上,并筛选出几个与之相关的候选基因(FARP2、PI4KA、FAM3D、NCOR2、ZNF827等).本研究初步发现,玻璃化冷冻牛卵母细胞体外受精囊胚的全基因组甲基化水平显著降低,且DMR区域主要集中在ATP结合、生长发育及组蛋白乙酰化,为提高玻璃化冷冻卵母细胞体外受精囊胚质量提供信息参考.

关键词：玻璃化冷冻、囊胚、全基因组、甲基化、差异甲基化区域

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分类号：S823.3(家畜)

资助基金：国家自然科学基金面上项目31472100;中国农业科学院科技创新工程ASTIP-IAS06;中国农业科学院“科研英才培育工程”

在线出版日期：2019-07-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1179-1188