猪主要经济性状的基因组选择研究

摘要：

旨在系统比较GBLUP、SSGBLUP、BayesA、BayesB、BayesC、BayesLASSO、BSLMM和BayesR等8种方法对猪重要经济性状基因组选择的准确性.本研究以本实验室收集的2 585头大白猪达100 kg日龄、达100 kg背膘厚和母猪乳头数3个性状为分析对象,结合猪50K基因芯片分型数据,以加性模型为基础,利用5倍交叉验证比较8种方法的基因组选择准确性.研究发现,基因组选择的准确性与不同性状估计遗传力呈正相关.交叉验证结果表明,预测准确性最高的性状为达100 kg日龄,但不同方法在不同性状中表现并不完全相同,在达100 kg日龄和达100 kg背膘厚中SSGBLUP基因组预测准确性均为最高,而在母猪乳头数中BayesA的基因组预测准确性最高.综上表明,对小样本开展基因组预测时,中、高等遗传力性状可以选择SSGBLUP方法,低等遗传力性状可以选择BayesA方法.如何优化和选择一种广泛适用于所有性状的方法,可能是未来研究的方向.

关键词：猪、基因组选择、遗传力、准确性

所属期刊栏目：50

分类号：S114;S828.2(农业数学)

资助基金：国家生猪产业技术体系项目CARS-35;国家自然科学基金地区间国际重大合作项目CGIAR31361140365;国家自然科学基金31672391;华中农业大学大北农青年学者提升专项资助项目2017DBN019

在线出版日期：2019-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：439-445