山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的转录组分析

摘要：

本研究旨在探究山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK细胞后的转录组基因变化情况,丰富CPIV3转录组信息.取1 MOI CPIV3 JSHA2014-1病毒液感染MDBK细胞,设非感染正常细胞为对照,于24 h后收获细胞,提取总RNA,利用Illumina HiSeqTM 2500对感染组与对照组进行高通量测序,并用测序评估、基因注释等生物信息学方法进行分析.结果显示,差异表达基因共261个,其中表达上调140个,表达下调121个,经RT-qPCR方法验证8个差异表达的干扰素信号通路相关基因,结果与高通量测序一致.进一步GO分类结果显示,差异表达基因主要涉及细胞生物学进程、构成细胞的组分以及实现的分子功能三个方面,KEGG分析显示这些基因参与代谢、生物系统、细胞进程、基因信息进程和环境信息进程.本研究为深入探究CPIV3的致病机制奠定了基础.

关键词：山羊副流感病毒3型、MDBK细胞、高通量测序、转录组

所属期刊栏目：50

分类号：S852.659.5(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金31702272;江苏省自然科学基金BK2017059;山东省自然科学基金ZR2016CP08;“十三五”国家重点研发计划项目2016YFD0500908

在线出版日期：2019-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：364-372