山羊DCT基因启动子区甲基化水平、SNP与毛色特征关系研究

摘要：

旨在探究DCT基因启动子区甲基化水平和SNP突变对山羊毛色的影响,为探索DCT基因调控山羊毛色变化的机理提供理论依据.本研究以山羊为试验动物,对DCT基因启动子区进行CpG岛预测,设计引物对预测的2个CpG岛富集区域进行亚硫酸氢盐甲基化测序,使用甲基化水平分析软件BISMA统计甲基化位点,比较唐山奶山羊(白色)和南江黄羊(黑色品系)两种不同毛色山羊群体DCT基因启动子区甲基化水平差异.克隆DCT基因核心启动子区,筛选不同毛色山羊群体的SNPs,使用JASPAR和Nsite预测SNPs位点突变前后转录因子的改变,并检测比较突变前后DCT基因启动子活性变化.结果,成功克隆了山羊DCT基因启动子区甲基化序列及核心启动子区(g.-1045～-318).在g.-348～-150区域和g.+222～+502区域分别发现6个和23个甲基化位点,其中g.+312、g.+352和g.+400位点与g.+389和g.+404位点白色山羊甲基化水平分别显著和极显著高于黑色山羊(P＜0.05和P＜0.01),并且g.+222～+502区域白色山羊甲基化平均水平极显著高于黑色山羊(P＜0.01).在DCT基因核心启动子区的g.-804 T＞G、g.-705 C＞T和g.-679 G＞A,3个SNPs位点的基因型构成在白色山羊和3个有色山羊群体中存在差异,g.-804 T＞G突变导致该区域的SOX10转录因子结合位点缺失,DCT基因启动子活性显著下降(P＜0.05).结果显示,白色山羊DCT基因g.+222～+502区域的高甲基化水平,g.-804、g.-714和g.-679 3个位点的突变,尤其是g.-804 T＞G造成SOX10转录因子结合位点的缺失,突变的G型DCT基因启动子活性显著降低.因此,DCT基因启动子区SNP突变和高甲基化水平可能抑制了基因的表达从而形成山羊白色被毛.

关键词：山羊毛色、DCT基因、启动子区、甲基化、SNP

所属期刊栏目：50

分类号：S827.2(家畜)

资助基金：河北省应用基础研究计划重点基础研究项目15962901d;河北省自然科学基金项目C2015204176

在线出版日期：2019-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：271-279