家兔矮小同源盒基因(Shox2)的克隆和表达分析

摘要：

为了研究新西兰白兔矮小同源盒基因(Shox2)序列,预测其结构和功能,以及研究Shox2基因的时空表达特征,本研究克隆了新西兰白兔Shox2基因全长CDS区,分析其编码蛋白的同源性、亲疏水性、二级和三级结构特点、系统进化树等生物信息学特征,并用Western blot法验证融合蛋白TrxA-Shox2.分别在胚胎中期(E20.5 d)、胚胎后期(E28.5 d)、幼龄期(出生后10 d)、成年期(A)4个时间点采集3只动物的肾、大血管、真皮、心、大脑、肝、肺、脾、肌肉、胆囊共10种组织,采用实时荧光定量PCR技术研究Shox2基因的时空表达图谱.结果,成功克隆了新西兰白兔Shox2基因(登录号:KP726285).Shox2基因CDS区全长666 bp,翻译221个氨基酸.生物信息学分析显示,Shox2为碱性、不稳定蛋白,Shox2蛋白氨基酸二级结构中α-螺旋区域占61.99％,无规则卷曲区域占33.48％,延伸链占4.52％.Western blot验证了融合蛋白TrxA-Shox2的表达.家兔Shox2蛋白氨基酸序列与眼镜猴、猩猩、褐家鼠、人的氨基酸序列同源性较高,说明Shox2蛋白在进化中较保守.Shox2基因mRNA在很多器官都有表达,在E20.5 d的家兔胚胎中,Shox2 mRNA在肾、肌肉和胆囊的表达量高,在E28.5 d时表达量较高的是脾、心,幼龄期时表达量较高的是真皮、肝,成年期时表达量较高的是真皮、脾.本研究成功克隆了新西兰白兔Shox2基因,预测了其结构和功能.Shox2基因mRNA在很多器官都有表达,不同的组织和不同时间特征的表达量变化可能与Shox2功能高度相关,并受到严格的调控.

关键词：家兔、矮小同源盒基因(Shox2)、克隆、生物信息学分析、表达图谱

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分类号：S829.12(家畜)

资助基金：国家重大支撑项目课题2014BAD13B03;西南民族大学研究生学位点建设项目2014XWD-S0906

在线出版日期：2019-03-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：61-70