转录组测序分析猪胚胎附植的中期和后期卵巢差异表达基因

摘要：

胚胎附植是影响母猪产仔数的一个重要因素,本研究旨在找到猪胚胎附植的关键调控基因.选用5～7胎次梅山猪母猪4头,在其妊娠第18和24天分别屠宰2头,采集其卵巢组织进行转录组测序(RNA-seq)分析,GO功能富集分析及Pathway分析.结果表明:1)猪胚胎附植中期卵巢(卵_18 d)和后期卵巢(卵_24 d)两个组织样检测到的表达基因中最多的序列(reads)均为外显子序列;卵_18 d测得reads最多的染色体依次为6、14、1和7号,卵_24 d依次为1、7、14和M号;卵_24 d相较于卵_18 d有更多的基因表达,且表达量更高;两个时期卵巢组织中表达量前50位的基因中,线粒体基因占60％以上.2)卵_24 d相较于卵_18 d,有581个基因上调和103个基因下调,其中二者之间表达差异最大的基因为EN19684,位于线粒体中;表达差异最大的染色体基因为EN11278,位于14号染色体中.3)差异表达基因显著富集于内皮细胞活化等38个生物学过程,宿主细胞质等19个细胞学分区和FAD-AMP裂解酶活性等16个分子功能;差异表达基因在185条生物通路上存在差异,其中前3位极显著差异的生物通路依次为PI3K-Akt信号通路、Hippo信号通路和昼夜周期.综上表明,在卵巢组织表达的基因,重点参与了胚胎附植后期的调控,且高表达量基因多集中在细胞线粒体中,差异表达基因功能以内皮细胞活化为主,生物通路以PI3K-Akt信号通路为主.

关键词：猪、胚胎附植、转录组测序、基因、表达

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分类号：S828.2(家畜)

资助基金：国家科技支撑计划项目2015BAD03B01-08;国家生猪现代产业技术体系南京综合试验站CARS-35;江苏省农业重大新品种创制项目PZCZ201733;江苏省农业科技自主创新资金项目CX172002;江苏省科技计划重点项目BE2017324;国家自然科学基金项目31201767

在线出版日期：2018-10-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1879-1888